シカジーニアス® 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用)2
下痢原性大腸菌(Diarrheagenic E. coli)は、ヒトに腹痛・下痢症を引き起こす大腸菌の総称であり、性質や症状 の違いにより5種類および他の下痢原性大腸菌に分類されます。 また、近年、大腸菌と近縁の下痢症起因菌であ るEscherichia albertii (E. albertii)を原因とする食中毒や集団感染事例がたびたび発生しております。
本製品は、マルチプレックスPCR 法により、下痢原性大腸菌のうち主な5 種類であるEHEC/VTEC (腸管出血性/ ベロ毒素産生性大腸菌)、EPEC(腸管病原性大腸菌)、ETEC(腸管毒素原性大腸菌)、EIEC(腸管侵入性大腸菌)、 EAggEC(腸管凝集付着性大腸菌)およびE. albertiiの病原性に関わる遺伝子を同時に検出できます。
特徴
- 2種類のプライマーミックスを用いて、大腸菌および E. albertii の菌種特異的遺伝子と7種類の病原性因子*1 を同時に、かつ区別して検出できます。
*1 病原性因子:ベロ毒素1, 2 型(VT1, 2)遺伝子(stx1, 2)、 耐熱性エンテロトキシン(ST)遺伝子(est)、易熱性エンテロトキシン(LT)遺伝子(elt)、インチミン遺伝子(eae)、凝集付着性関連因子(aggR)、腸管侵入性関連因子(invE) - 検出結果を数値化することで、判定結果を明確化できます。
- ポジティブコントロール等、PCRに必要な試薬が同梱しています。
- インターナルコントロールの検出結果から、PCR阻害の有無を確認できます。
キット構成(30回)
個別名称 | 容量 | 数量 | |
---|---|---|---|
試薬A | AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* | 400 µL | 1 本 |
試薬B | PCRサプリメント | 700 µL | 1 本 |
試薬C | プライマーミックス1 | 200 µL | 1 本 |
試薬D | プライマーミックス2 | 200 µL | 1 本 |
試薬E | ポジティブコントロール | 250 µL | 1 本 |
試薬F | 6×ローディングバッファー | 400 µL | 1 本 |
*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)は、Roche Diagnostics K.K.の商品です。
操作手順
- 増菌・分離培養
菌株を単離する - DNA抽出
シカジーニアス®DNA抽出試薬を用いてテンプレートDNAを調製する - PCR
2種類のマルチプレックスPCRを行う - 電気泳動
アガロースゲル電気泳動を行う - 検出
臭化エチジウム溶液で検出し、PCR断片を検出する - 判定
専用の計算シートに結果を入力し、病原型の判定を行う
検出対象遺伝子とその増幅サイズ
検出対象遺伝子 | 増幅サイズ(bp) | 遺伝子名 | |
---|---|---|---|
Reaction mixture 1 |
- | 652 | uidA (E. coli 判定領域 ) |
32 | 532 | stx1 | |
64 | 413 | stx2 | |
- | 252 | lysP (E. albertii 判定領域 ) | |
1 | 199 | eae | |
- | 120 | インターナルコントロール | |
Reaction mixture 2 |
2 | 499 | aggR |
4 | 379 | invE | |
8 | 270 | elt | |
16 | 191 | est | |
- | 120 | インターナルコントロール |
本キットでは、
* 志賀赤痢菌が保有する志賀毒素遺伝子も stx1として検出します。
* E.albertii が保有する stx2f バリアントも stx2 として検出します。
* Citrobactor 属が保有する eae も検出します。
* est のブタ型 (STp) とヒト型 (STh) の両方を検出します。
* 赤痢菌の大半が保有している uidA も検出するため、赤痢菌と大腸菌を区別することができません。
合計ポイントと病原型(大腸菌の場合)
合計ポイント | 病原型 |
---|---|
0 | EHEC/VTEC, EPEC, ETEC, EIEC, EAggEC 以外の大腸菌 |
1 | EPEC (eae+) |
2 | EAggEC (aggR+) |
4~7 | EIEC (invE+) |
8~15 | ETEC(elt+) |
16~23 | ETEC(est+) |
24~31 | ETEC(est+, elt+) |
32~63 | EHEC/VTEC (stx1+) |
64~95 | EHEC/VTEC (stx2+) |
96~127 | EHEC/VTEC (stx1+, stx2+) |
上記以外 | 生化学的性状等を併用して判断してください |
電気泳動のパターン
M:100 bp DNA Ladder, P:ポジティブコントロール , 1:E. coli ATCC 35150 (EHEC/VTEC),
2:E. coli ATCC 43887 (EPEC), 3:E. coli ATCC 35401 (ETEC), 4:E. coli NCTC 11603 (ETEC),
5:E. coli 分離株 (EAggEC), 6:E. coli ATCC 43893 (EIEC), 7:E. coli ATCC 11775 ( 非病原性 ),
8:E. albertii 分離株 (stx2f 陽性 ), 9:E. albertii LMG 20976, 10:Citrobacter freundii ATCC 8090,
N:ネガティブコントロール (TE 緩衝液 )
解析結果
サンプル番号 | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | |
係数の合計値 | 97 | 1 | 24 | 16 | 2 | 4 | 0 | 65 | 1 | 10 |
病原型の判定 | EHEC /VTEC (stx1+ stx2+ eae+) | EPEC (eae+) | ETEC (est+ elt+) | ETEC (est+) | EAggEC (aggR+) | EIEC (invE+) | 大腸菌 | E.albertii (stx2+ eae+) | E.albertii (eae+) | 菌種 判定 不能 |
製品一覧
製品番号 | 製品名 | 保存温度 | 規格 | 包装 | 詳細 |
---|---|---|---|---|---|
08377-96 | シカジーニアス 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用)2 | 冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(50回分) | |
08178-96 | シカジーニアス DNA抽出試薬 | 冷蔵 | 分子生物学用 | 1pack(120回分) |
・「法律」,「SDS」,「在庫」など詳細情報は、[Cica-Webで確認]ボタンをクリックいただきご確認いただけます。
・試薬のご購入とご使用に際して
パンフレット
シカジーニアス® 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用)
遺伝子検出関連製品ガイド
取扱説明書
計算シート(ZIPファイル、エクセル)
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