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シカジーニアス® 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用)2


下痢原性大腸菌(Diarrheagenic E. coli)は、ヒトに腹痛・下痢症を引き起こす大腸菌の総称であり、性質や症状 の違いにより5種類および他の下痢原性大腸菌に分類されます。 また、近年、大腸菌と近縁の下痢症起因菌であ るEscherichia albertii (E. albertii)を原因とする食中毒や集団感染事例がたびたび発生しております。
本製品は、マルチプレックスPCR 法により、下痢原性大腸菌のうち主な5 種類であるEHEC/VTEC (腸管出血性/ ベロ毒素産生性大腸菌)、EPEC(腸管病原性大腸菌)、ETEC(腸管毒素原性大腸菌)、EIEC(腸管侵入性大腸菌)、 EAggEC(腸管凝集付着性大腸菌)およびE. albertiiの病原性に関わる遺伝子を同時に検出できます。

特徴

  • 2種類のプライマーミックスを用いて、大腸菌および E. albertii の菌種特異的遺伝子と7種類の病原性因子*1 を同時に、かつ区別して検出できます。
    *1 病原性因子:ベロ毒素1, 2 型(VT1, 2)遺伝子(stx1, 2)、 耐熱性エンテロトキシン(ST)遺伝子(est)、易熱性エンテロトキシン(LT)遺伝子(elt)、インチミン遺伝子(eae)、凝集付着性関連因子(aggR)、腸管侵入性関連因子(invE)
  • 検出結果を数値化することで、判定結果を明確化できます。
  • ポジティブコントロール等、PCRに必要な試薬が同梱しています。
  • インターナルコントロールの検出結果から、PCR阻害の有無を確認できます。

キット構成(30回)

  個別名称 容量 数量
試薬A AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* 400 µL 1 本
試薬B PCRサプリメント 700 µL 1 本
試薬C プライマーミックス1 200 µL 1 本
試薬D プライマーミックス2 200 µL 1 本
試薬E ポジティブコントロール 250 µL 1 本
試薬F 6×ローディングバッファー 400 µL 1 本

*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)は、Roche Diagnostics K.K.の商品です。

操作手順

  1. 増菌・分離培養
    菌株を単離する
  2. DNA抽出
    シカジーニアス®DNA抽出試薬を用いてテンプレートDNAを調製する
  3. PCR
    2種類のマルチプレックスPCRを行う
  4. 電気泳動
    アガロースゲル電気泳動を行う
  5. 検出
    臭化エチジウム溶液で検出し、PCR断片を検出する
  6. 判定
    専用の計算シートに結果を入力し、病原型の判定を行う

検出対象遺伝子とその増幅サイズ

  検出対象遺伝子 増幅サイズ(bp) 遺伝子名

Reaction
mixture 1
- 652 uidA (E. coli 判定領域 )
32 532 stx1
64 413 stx2
- 252 lysP (E. albertii 判定領域 )
1 199 eae
- 120 インターナルコントロール
Reaction
mixture 2
2 499 aggR
4 379 invE
8 270 elt
16 191 est
- 120 インターナルコントロール

本キットでは、
* 志賀赤痢菌が保有する志賀毒素遺伝子も stx1として検出します。
* E.albertii が保有する stx2f バリアントも stx2 として検出します。
* Citrobactor 属が保有する eae も検出します。
* est のブタ型 (STp) とヒト型 (STh) の両方を検出します。
* 赤痢菌の大半が保有している uidA も検出するため、赤痢菌と大腸菌を区別することができません。

合計ポイントと病原型(大腸菌の場合)

合計ポイント 病原型
0 EHEC/VTEC, EPEC, ETEC, EIEC, EAggEC 以外の大腸菌
1 EPEC (eae+)
2 EAggEC (aggR+)
4~7 EIEC (invE+)
8~15 ETEC(elt+
16~23 ETEC(est+
24~31 ETEC(est+elt+
32~63 EHEC/VTEC (stx1+)
64~95 EHEC/VTEC (stx2+)
96~127 EHEC/VTEC (stx1+, stx2+)
上記以外 生化学的性状等を併用して判断してください

電気泳動のパターン

M:100 bp DNA Ladder, P:ポジティブコントロール , 1:E. coli ATCC 35150 (EHEC/VTEC), 
2:E. coli ATCC 43887 (EPEC), 3:E. coli ATCC 35401 (ETEC), 4:E. coli NCTC 11603 (ETEC), 
5:E. coli 分離株 (EAggEC), 6:E. coli ATCC 43893 (EIEC), 7:E. coli ATCC 11775 ( 非病原性 ), 
8:E. albertii 分離株 (stx2f 陽性 ), 9:E. albertii LMG 20976,  10:Citrobacter freundii ATCC 8090, 
N:ネガティブコントロール (TE 緩衝液 )


解析結果

  サンプル番号
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
係数の合計値 97 1 24 16 2 4 0 65 1 10
病原型の判定 EHEC /VTEC (stx1+ stx2+ eae+) EPEC (eae+) ETEC (est+ elt+) ETEC (est+) EAggEC (aggR+) EIEC (invE+) 大腸菌 E.albertii (stx2+ eae+) E.albertii (eae+) 菌種 判定 不能

製品一覧

製品番号 製品名 保存温度 規格 包装 詳細
08377-96 シカジーニアス 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用)2 冷凍 分子生物学用 1pack(50回分)
08178-96 シカジーニアス DNA抽出試薬 冷蔵 分子生物学用 1pack(120回分)

・「法律」,「SDS」,「在庫」など詳細情報は、[Cica-Webで確認]ボタンをクリックいただきご確認いただけます。
試薬のご購入とご使用に際して

パンフレット

シカジーニアス® 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用)
遺伝子検出関連製品ガイド

取扱説明書

病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用)

計算シート(ZIPファイル、エクセル)

解析用エクセルシート

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